Ответ:
Добрый день.
Если согласно вашей должности, вы являлись материально ответственным лицом и «штраф», как вы выразились, является именно суммой возмещения причиненного материального ущерба, вызванного вашими действиями (бездействиями), то да, вас обяжут выплачивать.
В других случаях необходимо смотреть условия трудового договора.